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自分のマシンは何 GFLOPS か? その 1

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自分のマシンは何 GFLOPS か知りたくなって、スパコン界隈で有名な LINPACK を実行してみようと思い立ちました。ソースコードは HPL- A Portable Implementation of the High-Performance Linpack Benchmark for Distributed-Memory Computers にあります。私は hpl-2.2.tar.gz を使用しました。

ビルド方法は INSTALL ファイルに書いてある通りですが、結構ハマったので、私の手順もメモしておきます。環境は Debian GNU/Linux Testing の amd64 版です。

LINPACK の Makefile

コードを展開し、setup ディレクトリの下にある Make.xxx をトップディレクトリにコピーして使います。たくさんファイルがありますが、Athlon マシンなので Linux_ATHLON_CBLAS を選びました。FBLAS という名前のファイルもありますが、

  • CBLAS: C 版
  • FBLAS: Fortran 版

のようです。用語の意味はわかりませんが、Makefile の diff を見れば何となくわかるはず、きっと。

ビルドの準備

コピーしてきた Make.Linux_ATHLON_CBLAS は書き換える必要があります。特に大事なのは TOPdir です。

この変更を忘れるとホームディレクトリ直下の hpl というディレクトリがトップディレクトリだと思って、ビルドを始めます。最終的に「Make.inc が見つからない」と言われて失敗します。

Make.inc を find で探すとわかりますが Make.inc はシンボリックリンクです。ビルドに失敗するときは Make.inc が全然関係ない場所を指していると思います。

もし TOPdir を書き換え忘れてビルドが失敗した場合は make arch=Linux_ATHLON_CBLAS clean_arch としてください。アーキテクチャ名の付いたディレクトリ(Make.inc もそのディレクトリに入っている)が全て消滅するはずです。

書き換え箇所
# TOPdir をソースコードを配置した位置に合わせて修正します
TOPdir = ...

# コンパイラを gcc から mpicc にします
CC = /usr/bin/mpicc
# リンカも gcc から mpicc にします
LINKER = /usr/bin/mpicc

# OpenMPI のライブラリ位置
MPdir = /usr/lib/x86_64-linux-gnu
MPinc = -I$(MPdir)/openmpi/include

# ビルドしたバイナリが動かなくなるため、MPlib は削除
#MPlib = ...

# LAlib のライブラリ位置
LAdir = /usr/lib/x86_64-linux-gnu
# スタティックリンクだとなぜか遅いので、ダイナミックリンクに変更
LAlib = -lcblas -latlas

# 末尾に -lrt -lbacktrace を追加します。
# HPL_LIBS の先頭に追加するとリンクエラーになります。
HPL_LIBS = ... -lrt -lbacktrace

あと、私の環境の場合、下記パッケージのインストールが必要でした。

  • libopenmpi-dev
  • libmpich-dev
  • libatlas-base-dev

実行はまた今度にします。

[編集者: すずき]
[更新: 2018年 8月 15日 10:08]
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コメント一覧

  • hdk 
    LINKERも変えるんですかね(ちゃんと理解してない) 
    (2018年08月14日 00:11:45)
  • すずき 
    あ、そうでした、LINKER も mpicc に変えないと、めちゃくちゃエラーが出ます…。 
    (2018年08月14日 00:20:15)
  • すずき 
    LINKER の記述も足しておきました。 
    (2018年08月14日 00:33:11)
  • すずき 
    LAlib をダイナミックリンクにする記述も足しました。 
    (2018年08月14日 12:34:56)
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