自分のマシンは何GFLOPSか知りたくなって、スパコン界隈で有名なLINPACKを実行してみようと思い立ちました。ソースコードは HPL- A Portable Implementation of the High-Performance Linpack Benchmark for Distributed-Memory Computers にあります。私はhpl-2.2.tar.gzを使用しました。
ビルド方法はINSTALLファイルに書いてある通りですが、結構ハマったので、私の手順もメモしておきます。環境はDebian GNU/Linux Testingのamd64版です。
コードを展開し、setupディレクトリの下にあるMake.xxxをトップディレクトリにコピーして使います。たくさんファイルがありますが、AthlonマシンなのでLinux_ATHLON_CBLASを選びました。FBLASという名前のファイルもありますが、
のようです。用語の意味はわかりませんが、Makefileのdiffを見れば何となくわかるはず、きっと。
コピーしてきたMake.Linux_ATHLON_CBLASは書き換える必要があります。特に大事なのはTOPdirです。
この変更を忘れるとホームディレクトリ直下のhplというディレクトリがトップディレクトリだと思って、ビルドを始めます。最終的に「Make.incが見つからない」と言われて失敗します。
Make.incをfindで探すとわかりますがMake.incはシンボリックリンクです。ビルドに失敗するときはMake.incが全然関係ない場所を指していると思います。
もしTOPdirを書き換え忘れてビルドが失敗した場合はmake arch=Linux_ATHLON_CBLAS clean_archとしてください。アーキテクチャ名の付いたディレクトリ(Make.incもそのディレクトリに入っている)が全て消滅するはずです。
# TOPdirをソースコードを配置した位置に合わせて修正します TOPdir = ... # コンパイラをgccからmpiccにします CC = /usr/bin/mpicc # リンカもgccからmpiccにします LINKER = /usr/bin/mpicc # OpenMPIのライブラリ位置 MPdir = /usr/lib/x86_64-linux-gnu MPinc = -I$(MPdir)/openmpi/include # ビルドしたバイナリが動かなくなるため、MPlibは削除 #MPlib = ... # LAlibのライブラリ位置 LAdir = /usr/lib/x86_64-linux-gnu # スタティックリンクだとなぜか遅いので、ダイナミックリンクに変更 LAlib = -lcblas -latlas # 末尾に -lrt -lbacktraceを追加します。 # HPL_LIBSの先頭に追加するとリンクエラーになります。 HPL_LIBS = ... -lrt -lbacktrace
あと、私の環境の場合、下記パッケージのインストールが必要でした。
実行はまた今度にします。
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